Über ginput und peakdet Minima und Maxima manuell definiere

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Verfasst am: 03.03.2017, 18:21 Titel: Über ginput und peakdet Minima und Maxima manuell definiere

Liebe Community,
ich arbeite an mitochondrialen Signalen, die über Änderungen des Grauwertes gemessen werden.
Die Mittelwerte der einzelnen Mitochondrien sind in der Zelle gpmean gespeichert. Nun möchte mein Betreuer, dass ich MANUELL (!) für einzelne Mitochondrien die Minima und Maxima festlege, und diese Werte für jedes Mitochondrium, das ich untersuche, gespeichert werden. Als Hilfe hat er mir folgendes gegeben:

- das sei wohl am einfachsten mit drei Loops, um
1. Peaks
2. Valleys und
3. Signalpausen zu (also z.B. das Intervall x1-x2, in dem das Signal stabil bleibt)
messen. Signalpausen müssten dann je Pause logischerweise zwei Werte sein, die matlab daran erkennt, dass dazwischen weder ein Peak noch ein valley liegt, so meine Theorie)

- er meinte ich brauche dafür ginput und Peakdet.

- selbst herausgefunden habe ich folgendes für beispielsweise Mito Nummer 2:

Code:

figure; plot(gpmean{2,1});
[maxtab, mintab] = peakdet(gpmean{2,1}, 30);
hold on; plot(mintab(:,1), mintab(:,2), 'g*'); plot(maxtab(:,1), maxtab(:,2), 'r*');

Funktion ohne Link?

Ich erhalte damit angehängte Grafik. Ich habe versucht da irgendwie das ginput einzubauen, damit ich und nicht matlab entscheidet, was ich als Peak und valley definieren möchte, aber das schaffe ich nicht. Diese Werte sollen dann am Ende mit X und Y Wert abgepeichert werden für je Valley, peaks und Pausenintervalle.

Versteht irgendwer was ich meine und kann mir helfen? Very Happy

Das wäre wirklich toll!
Vielen Dank schonmal im Voraus und einen schönen Freitagabend!

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