Boxplots nach Mediane sortieren

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mchatt

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Verfasst am: 31.05.2021, 17:22 Titel: Boxplots nach Mediane sortieren

Hallo Zusammen,

ich habe folgende Frage:
Ich habe mehrere Boxplots auf einem Figure erstellt und würde sie gerne nach Mediane sortieren. Also es soll so aussehen, dass der Box mit der kleinsten Median ganz links und der mit dem größsten Median ganz rechts ist.
Ich habe folgende Lösung gefunden, aber ich kriege die Fehlermeldung:
"First input SUBS must contain positive integer subscripts."

Code:

Data_1 = [10,2,3,4,5,6,7,8,9];
groups_1 = [1,1,2,2,3,3,4,4,5];

[~,ind] = sort(accumarray(groups_1.',Data_1,[],@mean));
ord1 = sortrows([(1:max(groups_1)).' ind],2);
% without repelem:
a = ord1(:,1);
b = histcounts(groups_1);
idx(cumsum([1 b(b>0)])) = 1;
c = a(cumsum(idx(1:find(idx,1,'last')-1)));
Data_Corrected_1 = sortrows([c groups_1.' Data_1.'],1);
% with repelem:
% Data_Corrected_1 = sortrows([repelem(ord1(:,1),histcounts(groups_1))...
% groups_1.' Data_1.'],1);
boxplot(Data_Corrected_1(:,3),Data_Corrected_1(:,1));

Funktion ohne Link?

Bitte um Eure Hilfe und ich freue mich auf Eure Antwort!

Vielen Dank!
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mchatt

Harald

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Verfasst am: 31.05.2021, 18:50 Titel:

Hallo,

bei mir läuft der Code so fehlerfrei durch. Vielleicht mal den Workspace leeren und nochmal versuchen. Falls das Problem weiterhin besteht: welches Release verwendest du?

Im übrigen sortiert der Code nach Mittelwert, nicht nach Median.

Grüße,
Harald
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Verfasst am: 31.05.2021, 19:08 Titel:

Hallo,

danke für Deine Antwort. Also ich habe ein größeren Datensatz und dieser Code funkltoniert bei mir nicht, weil meine Daten negative Werte enthält. Diese Lösung habe ich im Internet gefunden. Anscheinend tut sie nicht das was ich haben möchte.

Hättest Du vielleicht eine Idee, wie man das mit dem Median macht? Ich konnte im Internet leider nichts dazu finden!

Vielen Dank!
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mchatt

Harald

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Verfasst am: 31.05.2021, 20:02 Titel:

Hallo,

Zitat:

Also ich habe ein größeren Datensatz und dieser Code funkltoniert bei mir nicht, weil meine Daten negative Werte enthält.

Negative Daten sollten kein Problem sein. Sind die Gruppen auch negativ? Das wirkt dann merkwürdig auf mich. Poste bitte generell Beispiele, bei denen die Probleme auch auftreten.

Zitat:

Anscheinend tut sie nicht das was ich haben möchte.

Mit dem Beispieldatensatz sieht es doch gut aus. Was bei deinem Datensatz ggf. schief geht, sieht man erst, wenn man es auf deinen Datensatz anwendet.

Zitat:

Hättest Du vielleicht eine Idee, wie man das mit dem Median macht?

@median statt @mean verwenden. Sollte an sich naheliegend sein.

Grüße,
Harald
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Verfasst am: 31.05.2021, 20:33 Titel:

Hallo,

alles klar, das macht Sinn. Hier ist mein Code und ich habe noch ein Ausschnitt vom Datensatz angehängt Smile

Vielen Dank!

Code:

opts = detectImportOptions('C:\Users\MCP\Desktop\Beispiel\Daten');
Table_1 = readtable('C:\Users\MCP\Desktop\Beispiel\Daten.txt', opts);
Array=table2array(Table_1);
groups_1= Array(:,1).'; Data_1=Array(:,2);
[~,ind] = sort(accumarray(groups_1.',Data_1,[],@mean));
ord1 = sortrows([(1:max(groups_1)).' ind],2);
% with repelem:
Data_Corrected_1 = sortrows([repelem(ord1(:,1),histcounts(groups_1))...
groups_1.' Data_1.'],1);
boxplot(Data_Corrected_1(:,3),Data_Corrected_1(:,1));

Funktion ohne Link?

Herzliche Grüße,

Daten.txt

Beschreibung:

Download

Dateiname:

Daten.txt

Dateigröße:

11.05 KB

Heruntergeladen:

158 mal

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Verfasst am: 31.05.2021, 21:44 Titel:

Hallo,

das Problem waren nicht negative Zahlen, sondern fehlende (NaN) und nicht aufeinanderfolgende Gruppenangaben.
Dann wäre noch die Empfehlung, nicht nach irgendwelchen, möglicherweise sehr veralteten Code-Schnipseln im Internet zu suchen, sondern erst mal die Dokumentation zu bemühen. Warum dieses ganze Gefrickel, wenn boxplot die Option GroupOrder anbietet, die genau dafür gedacht ist?

Code:

opts = detectImportOptions('Daten.txt');
Table_1 = readtable('Daten.txt', opts);
Table_1 = rmmissing(Table_1);
Array=table2array(Table_1);
groups_1= categorical(Array(:,1)); Data_1=Array(:,2);
[~,ind] = sort(groupsummary(Data_1, groups_1,@median));
cats = categories(groups_1);
boxplot(Data_1, groups_1, 'GroupOrder', cats(ind));

Funktion ohne Link?

Grüße,
Harald
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mchatt

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Verfasst am: 01.06.2021, 07:28 Titel:

Hallo,

vielen Dank! es hat funktioniert Smile

Ich habe mir die Doku schon angeguckt und konnte leider dies nicht herausfinden! Danke für Deine Hilfe Smile

Ich habe noch eine Frage: Wie könnte man nun die Boxplots nach der größe des Interquantilbereichs sortieren? Also der kleinste Box ganz links und der größte ganz rechts.

Herzliche Grüße,
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mchatt

Harald

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Verfasst am: 01.06.2021, 08:37 Titel:

Hallo,

Zitat:

Wie könnte man nun die Boxplots nach der größe des Interquantilbereichs sortieren? Also der kleinste Box ganz links und der größte ganz rechts.

@iqr statt @median

Grüße,
Harald
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