Dicom Bilder einlesen und als Video ausgeben

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LisaSchoe

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Verfasst am: 22.04.2016, 16:51 Titel: Dicom Bilder einlesen und als Video ausgeben

Hey Leute,

ich bin ganz neu auf dem Gebiet der Bildverarbeitung und weiß nicht so recht, wie ich mein Problem angehen soll Sad

Und zwar folgendes:

Ich habe 26 Dicom-Bilder gegeben.
Diese will ich mit Matlab einlesen und schließlich als Videosequenz ausgeben.
Die Bilder haben Namen wie folgt: IMG-0001-00001.dcm bis IMG-0026-00001.dcm

Ich weiß, dass man das Problem mit einer Schleife lösen kann, jedoch bin ich bisher zu keiner sinnvollen Lösung gekommen.

Danke schon mal im Voraus! Smile

Winkow

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Verfasst am: 23.04.2016, 08:45 Titel:

was hast du denn bis jetzt versucht und welche probleme sind dabei aufgetreten? sihe dazu auch den thread aus meiner signatur.
grüße winkow
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richtig Fragen

LisaSchoe

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Verfasst am: 24.04.2016, 10:29 Titel:

Naja ich hatte mal im Internet eine vorgeschriebene for-Schleife gefunden und hatte versucht diese an mein Problem anzupassen. Leider ist mir das irgendwie verloren gegangen, da ich es anscheinend nicht richtig gespeichert hatte.
Ich stehe jetzt wieder vor dem Nichts, weil ich diese vorgeschriebene Schleife auch nicht mehr finde im Internet.

Ich bin mittlerweile echt am verzweifeln, da ich auch nicht die größten Matlab-Kenntnisse habe und schon gar nicht in Richtung Bildverarbeitung. Jedoch muss ich zu diesem Thema ein Projekt durchführen und stehe echt vor Problemen Sad

Winkow

Moderator


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Verfasst am: 24.04.2016, 10:38 Titel:

dann zeig doch mal was du bis jetzt versucht hast? das einlesen der bilder bruach ja nur 3 befehle for dir dicomread
wenn du garnicht mit matlab gearbeitet hast dann kann ich das getting startet und matlab onramp empfehlen. das beantwortet 90% der fragen die man so als anfänger hat.
grüße
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LisaSchoe

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Verfasst am: 24.04.2016, 18:44 Titel:

Also, z.B habe ich jetzt das hier:

Code:

dicomlist = dir(fullfile(pwd,'p01','*.dcm'));
for cnt = 1 : numel(dicomlist)
I{cnt} = dicomread(fullfile(pwd,'p01',dicomlist(cnt).name));
end

implay(I{cnt})

Funktion ohne Link?

Ich verstehe was da passiert und das zeigt mir auch etwas an. Jedoch nur ein einziges Bild ....
edit winkow: bitte code umgebung verwenden

Winkow

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Verfasst am: 24.04.2016, 19:20 Titel:

ich glaube implay ist nicht für cells. steht jedenfalls so nicht in der doc. außerdem rufst du eh implay nur mit dem letzten element der cell auf. speicher das mal in einem 3d array. dann sollte es klappen.
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richtig Fragen

LisaSchoe

Gast


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Verfasst am: 25.04.2016, 12:44 Titel:

Mhm okay.... Mal davon abgesehen, dass ich nicht weiß, wie ich das machen kann, wird mir der implay Befehl wahrscheinlich nicht helfen.
Denn ich will die Bilderfolge dann noch mit der Hough Transformation bearbeiten...

Jan S

Moderator


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Verfasst am: 25.04.2016, 21:48 Titel:

Hallo LisaSchoe,

Was bedeutet eigentlich "als Video ausgeben"? Als File oder auf dem Bildschirm?
Möchtest Du die Hough-Transformation auf die Bilder-Folge anwenden, oder auf die einzelnen Bilder?

Gruß, Jan

LisaSchoe

Gast


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Verfasst am: 26.04.2016, 07:13 Titel:

Also meine Aufgabe ist die folgende:

Ich soll eine Video-Sequenz einer CT-Aufnahme bearbeiten. Dafür habe ich etwa 70 Bilder.
Und zwar handelt es sich in der Video-Sequenz um eine Punktion im Abdomen.
Ich soll nun die Punktionsnadel detektieren.

Das heißt, ich muss erstmal alle Bilder einlesen, sodass ich diese Video-Sequenz erhalte und muss das dann noch bearbeiten mit der Hough-Transformation.
Also werde ich wohl eher die Hough-Transformation auf die einzelnen Bilder anwenden und diese dann auf dem Bildschirm ausgeben.


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