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Distanzen berechnen

 

karschie
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Beiträge: 1
Anmeldedatum: 22.04.08
Wohnort: ---
Version: ---
     Beitrag Verfasst am: 16.05.2008, 00:14     Titel: Distanzen berechnen
  Antworten mit Zitat      
Hallo,

ich möchte aus zwei Distanzvektoren, die nicht die gleiche Länge haben, Abstände zwischen denk Punkten berechnen, um den kleinsten Abstand zu finden. Die Einträge der Vektoren sind der Größe nach von klein nach groß geordnet.

Im Moment, mach ich das so:

Code:
[X Y] = meshgrid(DNA_position(1,:),DNA_position(2,:));

dsb_counter=length(find(abs(Y-X)<3));


Meshgrid frisst aber zu viel Zeit, weil mein Positionsvektorein paar Tausendeinträge hat und ich die Abstände sehr oft checken muss.

Hat jemand vielleicht eine Idee?

Viele Grüße,

karschie
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steve
Ehrenmitglied

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Beiträge: 2.029
Anmeldedatum: 03.09.07
Wohnort: Wien
Version: R2024a
     Beitrag Verfasst am: 29.05.2008, 09:49     Titel:
  Antworten mit Zitat      
*push*

Eine Lösung des Problems würde mich auch interessieren...
_________________

>> I told me to.

____________________________________
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dabauer82
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Beiträge: 184
Anmeldedatum: 21.03.08
Wohnort: ---
Version: R2008a, R2010b
     Beitrag Verfasst am: 29.05.2008, 11:04     Titel:
  Antworten mit Zitat      
hilft das?

Code:
function dist = distancePoints3d(p1, p2, varargin)
%DISTANCEPOINTS3D compute euclidean distance between 3D Points
%
%   D = distancePoints3d(P1, P2) return distance between points P1 and
%   P2, given as [X Y Z].
%  
%   If P1 and P2 are two arrays of points, result is a N1*N2 array
%   containing distance between each point of P1 and each point of P2.
%
%
%   D = distancePoints3d(P1, P2, NOR)
%   with NOR being 1, 2, or Inf, corresponfing to the norm used. Default is
%   2 (euclidean norm). 1 correspond to manhattan (or taxi driver) distance
%   and Inf to maximum difference in each coordinate.
%
%
%   See also :
%       distancePointsN, minDistancePoints
%
%   ---------
%
%   author : David Legland
%   INRA - TPV URPOI - BIA IMASTE
%   created the 18/02/2005.
%

%   HISTORY
%   21/02/2005 : add differnet norms

norm = 2;
if length(varargin)==1
    norm = varargin{1};
end

% number of points of each array
n1 = size(p1, 1);
n2 = size(p2, 1);

% compute difference of coordinate for each pair of point ([n1*n2] array)
dx = repmat(p1(:,1), [1 n2])-repmat(p2(:,1)', [n1 1]);
dy = repmat(p1(:,2), [1 n2])-repmat(p2(:,2)', [n1 1]);
dz = repmat(p1(:,3), [1 n2])-repmat(p2(:,3)', [n1 1]);

switch(norm)
    case 1
        dist = abs(dx) + abs(dy) + abs(dz);
    case 2
        dist = sqrt(dx.*dx + dy.*dy + dz.*dz);
    case Inf
        dist = max([abs(dx) abs(dy) abs(dz)], [], 2);
    otherwise
        dist = power(power(dx, norm) + power(dy, norm) + power(dz, norm), 1/norm);
end
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