hilfe für plot mit images (.tiff)

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ThomsDay

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Verfasst am: 04.06.2022, 17:49 Titel: hilfe für plot mit images (.tiff)

Ich versuche gerade einen Plot wie den am Bild zu erstellen,
Leider schaffe ich es nicht die daten schön zu plotten.
verwende "slice()"
damit entsteht aber auch kein vernünftiger plot. gibt es bessere funktionen?
und wie kann ich den plot rund zuschneiden? werte auf 0 setzten oder auf nan funktioniert nicht.
DANKE

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Harald

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Verfasst am: 04.06.2022, 19:04 Titel:

Hallo,

wie genau sehen denn deine Daten aus? Ideal wäre es, ein Datenbeispiel anzuhängen. Zumindest benötigen wir aber eine Beschreibung der Daten.

Zitat:

werte auf 0 setzten oder auf nan funktioniert nicht.

Inwiefern funktioniert es nicht? Vielleicht setzt du nicht die richtigen Werte auf NaN? Bitte poste den verwendeten Code.

Grüße,
Harald
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ThomsDay

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Verfasst am: 04.06.2022, 19:06 Titel:

die daten sind einfach .tiff files. sprich die lese ich ein und habe dann ein array (1024x1024) davon 41 stk.

07_k_PE50_FoV4c6_Escan_ap1750_HIS_CuKFU_AV_001.TIF

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ThomsDay

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Verfasst am: 04.06.2022, 19:07 Titel:

Code:

clear all
close all
radius = 420;
N = 1024;
Mitte = N/2;
[xx,yy] = meshgrid(1:N,1:N);
dr = xx(2)-xx(1);
r = sqrt((xx-Mitte).^2+(yy-Mitte).^2);

images = ones(1024,1024,41);
for i = 1:41
if i < 10
string = ['07_k_PE50_FoV4c6_Escan_ap1750_HIS_CuKFU_AV_00',num2str(i),'.TIF'];
data = imread(string);
data = im2double(data);
data = medfilt2(data); % filter
data = data-min(data(:));
data(data<max(data(:))./2)=0;
%data = data./sum(data(:));

data(r - dr/2 > radius) = 0;
%data = data./sum(sum(data));
%data(r==radius) = 1;
%data(1:Mitte,Mitte:end) = 0;
images(:,:,i)= data;
else
string = ['07_k_PE50_FoV4c6_Escan_ap1750_HIS_CuKFU_AV_0',num2str(i),'.TIF'];
data = imread(string);
data = im2double(data);
data = medfilt2(data);
data = data-min(data(:));
data(data<max(data(:))./2)=0;
%data = data./sum(data(:));
%data = data./sum(sum(data));

data(r - dr/2 > radius) = 0;
%data = data./sum(sum(data));
%data(r==radius) = 1;
%data(1:Mitte,Mitte:end) = 0;
images(:,:,i)= data;
end
end
Energies = linspace(19.5,21.5,41);
figure;
%slice(images,[],[],Energies);
slice(images(100:924,100:924,:),512,512,1);
shading interp
%set(hs,'FaceAlpha',0.9);

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