Keine Ahnung warum bei imwrite keine Graustufen gesetzt werd

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xwinnipuhx

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Verfasst am: 16.05.2012, 11:48 Titel: Keine Ahnung warum bei imwrite keine Graustufen gesetzt werd

wenn ich ein Bild(Graustufenbild) aus meiner bildserie einlese es durch FFT transformiere und anschließend durch IFFT wieder zurücktransformiere kann ich es über imwrite nicht mehr "richtig" speichern.
Max = 242
Min = 0
auch nach der Tranaformation

Code:

a = fft(img)
b = ifft(a)

Funktion ohne Link?

mit

Code:

imshow(b, [0 242])

Funktion ohne Link?

bekomm ich das bild wieder richtig mit den originalfarbwerten dargestellt.

wie bekomm ich das nun bei imwrite hin?
das einfügen einer colormap(gray) hat mir bis jetzt noch nicht richtig geholfen.

Hubertus

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Verfasst am: 16.05.2012, 12:07 Titel:

Ist dein Bild wirklich ein Graustufenbild oder grauer Inhalt als m*n*3 gespeichert oder ist es Index-Bild. Ich kann bei einem m*n Bild kein Problem sehen. Du schreibst einerseits von einem Graustufenbild und von "originalfarbwerten"! Ein Colorbild wird aber verfälscht wiedergegeben.

Hubertus

xwinnipuhx

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Verfasst am: 16.05.2012, 12:17 Titel:

danke erstmal für deine antwort. im anhang eins der bilder. die info sagt mir colortyp = grayscale

ich mein mit farbwerten die graustufen Smile

striped_raw_00.tif

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Hubertus

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Verfasst am: 16.05.2012, 12:34 Titel:

Leider zeigt das Bild nicht dein Problem, du müstest schon das Eingangs- und Ausgangsbild anhängen. Die ifft gibt double zurück. Wandel nach uint8 um, dann müßte das Problem behoben sein.

Etwas ist merkwürdig. Ich habe ein Testbild 512*512 mit weißem Untergrund und 1 schwarzer Balken. Das Bild wird mit deiner Befehlsfolge korrekt gespeichert ( auch in anderen Programmen zu öffnen ). Der gleiche Versuch mit dem bekannten cameraman.tif zeigt die typische leere figure, wenn nicht nach uint8 gewandelt wurde.

xwinnipuhx

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Verfasst am: 16.05.2012, 12:47 Titel:

danke dir

leider sieht es immer noch nicht so aus wie es aussehen soll Sad

ich habe 9 bilder die alle so ähnlich sind wie das bereits gepostete. alle 9 werden fourier transformiert aufsummiert und die entstandene matrix zurücktransformiert.

in meinem anderen post:
http://www.gomatlab.de/hilfe-colorm.....it-graustufen-t23649.html

habe ich das problem schon einmal geschildert

bin absolut ratlos

Hubertus

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Verfasst am: 16.05.2012, 13:12 Titel:

Du schreibst in dem Beitrag:

Zitat:

das beste ergebnis war bis jetzt mit
Code:
imshow(realImg,[9 1383]);

Wenn du Werte über 255 hast, dann normieren diese mit:

Code:

norm=b-min(b(:));
norm=255*b/max(b(:));
imwrite(norm.....)

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Hubertus

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Verfasst am: 16.05.2012, 13:19 Titel:

Wenn Du Bilder aufsummiert ist eigentlich zu erwarten, dass sich die Grauwerte erheblich verschieben. Dann hilft nur Bildverarbeitung und dann liegt das nicht an der FFT.

xwinnipuhx

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Verfasst am: 16.05.2012, 13:23 Titel:

hört sich gut an nur wie stell ich das am besten an kann schon nicht mehr klar denken heut

meine variante ist ja offensichtlich falsch ich muss doch beide normierungen irgendwie in einer variablen zusammen fassen oder?

Code:

newimg = ifft(S);
realImg = real(newimg);
norm = realImg-min(realImg(:));
norm = 255*realImg/max(realImg(:));
%finalImg = uint8(realImg);

imwrite(norm,"neu2.tif")

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xwinnipuhx

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Verfasst am: 16.05.2012, 13:25 Titel:

@ hubertus

und warum sieht das bild als txt-file über imageJ geöffnet dann super aus?

Hubertus

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Verfasst am: 16.05.2012, 13:32 Titel:

Die Darstellung von Bilder ist in vielen Programmen sehr unterschiedlich und auch Matlab macht einem das Leben nicht leicht. Denn was Matlab abbildet ist nicht immer das, was gespeichert wird. Da kann man sich ja auch mal fragen, warum das nicht einfacher gemacht wurde. Ich vermute aber, das dein Überlagern das eigentliche Problem ist. Wenn ich 2 gleiche Bilder überlager, entsteht je nach dem, wie die beiden Bilder verrechnet werden ein dunkleres, kontrastreicheres Bild.

Sehe dir erst einmal 2 Bilder an, die du überlagern willst und dann das Ergebnis. Wenn sich die Graustufen erheblich ändern, mußt du zwischen den beiden Bilder eine Hístogrammnormierung vornehmen und dann auf jedes weitere Bild. Ich kenne deinen Auftrag nicht und was du darstellen willst. Soll das Bild insgesamt heller und/ oder kontrastreicher werden?

xwinnipuhx

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Verfasst am: 16.05.2012, 13:37 Titel:

es sind 9 bilder die alle anders belichtet wurden (mikroskopie-Aufnahmen) durch eine streifenweise belichtung. ziel ist es mittels FFT die laterale Auflöung (x-y) zu verbessern also aus den 9 einzelbildern ein bild machen

Hubertus

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Verfasst am: 16.05.2012, 13:47 Titel:

Ich denke Mikroskopbilder sind auch nur Graustufenbilder. Man kann bestimmte Bildinhalte nicht einfacher übereinanderlegen. In vielen Programmen wird durch Überlagerung der Gesamtkontrast verbessert, wenn die Bilder eine flache Gradation haben. Daraus kannst du entnehmen, dass Überlagerungen - ohne kontrastveränderten Berechnungen - zu einem dichteren und kontrastreicherem Bild führen.

Wenn du das an einem Beispiel mit 2 Bilder prüfst, kannst du beurteilen, ob noch ein paar Schritte dazwischen ausgeführt werden müssen.

Wenn die Bilder ohnehin unterschiedlich belichtet sind, bleibt dir schon mal gar nichts anderes übrig. Überlager erst einmal 2 Bilder und normiere das Histogram. Dann überlagerst du das 3. Bild mit dem vorherigen Ergebnis und normierst wieder usw.

xwinnipuhx

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Verfasst am: 16.05.2012, 14:25 Titel:

sorry aber ich habe keine ahnung wie ....

werd auch nicht aus dem vorgeschalgenem code zur normierung schlau, ich kann doch in imwrite keine weitere funktion mit übergeben

Hubertus

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Verfasst am: 16.05.2012, 15:04 Titel:

Alles kein Problem. Hier sind viele, die dir helfen wollen. Ich glaube nicht, dass dein Problem FFT heißt sondern die Überlagerungen bewirken das unzufriedende Resultat. Was passiert, wenn man Bilder zusammenrechnet, siehst du hier:

Code:

I=imread('cameraman.tif');
figure; imshow(I)
I2=I+I;
figure; imshow(I2)
I3=I-I;
figure; imshow(I3)
I4=I+I/2;
figure; imshow(I4)

Funktion ohne Link?

In diesem Beispiel wurde das gleiche Bild mit sich selbst verrechnet. Probiere das mal mit 2 unterschiedlichen Bildern, die aber alle gleich groß sein müssen, also alle 512*512 oder so ähnlich. Wenn du 2 unterschiedliche Bilder zusammen rechnest, ergibt das ein andere Darstellung. Es kommt aber immer auf den Bildinhalt an.

Dann verrechne ein normales Bild mit einem Bild, dass du vorher heller oder dunkler gemacht hast. Und das wie folgt:

Code:

I=imread('cameraman.tif');
I2=I+100; % das Bild wird aufgehellt um den Offset 100
I3=I*0.5; % das Bild wird abgedunkelt

Verrechnet jetzt die Bilder miteinander und sehe dir an, wie sich die Ergebnisse zu den verrechneten Bildern verhalten.

Der nächste Schritt ist eine Funktion zur Hisogrammnormierung, also nicht einfach nur heller oder dunkler.

Melde dich wieder und beschreibe mal genauer, was an deinem Bild falsch ist ( zu dunkel, zu kontrastreich oder....)

Funktion ohne Link?

Mach dir zusätzlich zu diesem Versuch mal ein Bild vom Histogramm. Das ist aufschußreicher als nur das reine Bild. Dazu folgendes Beispiel:

Code:

i=imread('cameraman.tif');
i=double(i);
figure; imshow(i,[0 255])
inh=histc(i(1:prod(size(i))),0:255);
figure; bar(inh)

Funktion ohne Link?

Ein gut durchgezeichnetes Bild sollte bei 0 beginnen und bei 255 enden.


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