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Problem mit SPM und Matlab

 

Cerebro
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     Beitrag Verfasst am: 02.08.2010, 20:23     Titel: Problem mit SPM und Matlab
  Antworten mit Zitat      
Hallo allerseits,

ich arbeite mit MRI-Daten und benutze dabei SPM8 und die Matlab-Version 2009a. Derzeit verwende ich einen Mac mit OS X 10.6.3 und erhalte beim Durchlaufen eines bestimmten Vorverarbeitungsprozesses folgende Fehlermeldung:

Dyld Error Message:
Symbol not found: _ornlm
Referenced from: /Users/Downloads/spm8/toolbox/vbm8/ornlmMex.mexmaci
Expected in: flat namespace

Ich habe leider keine Ahnung was dieser Fehler bedeuten kann und bin auch nach einer ausgiebigen Google-Recherche noch nicht schlauer geworden. Eventuell hat jemand von Euch ja schonmal diese Fehlermeldung gehabt und könnte mir weiterhelfen, das wäre sehr hilfreich!
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Andreas Goser
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     Beitrag Verfasst am: 03.08.2010, 09:08     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Das bedeutet, dass der Fehler in einer MEX Datei auftritt die der SPM Hersteller liefert. D.h. es ist das Beste den Hersteller zu kontaktieren. Unter
http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm8/
Gibt es auch eine Email-Liste.

Andreas
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Cerebro
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     Beitrag Verfasst am: 03.08.2010, 09:40     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Vielen Dank für die hilfreiche Antwort, ich habe jetzt mal die SPM und VBM-Hersteller kontaktiert eventuell können die mir ja weiterhelfen.

Könnte denn das Problem auch damit zusammenhängen, dass ich eine 32-Bit Version von Matlab auf einem 64-Bit Rechner verwende, oder spielt das keine Rolle?
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Andreas Goser
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     Beitrag Verfasst am: 03.08.2010, 12:22     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Denkbar, aber MEXMACI ist die Extension für 32 Bit MATLAB auf Mac - insofern in sich konsistent. MEXMACI64 würde eine MEX Datei für 64 Bit MATLAB sein. Da die typischen SPM Anwendungen recht speicherintensiv sind, ist 64 Bit MATLAB zu empfehlen.

Andreas
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Cerebro
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     Beitrag Verfasst am: 03.08.2010, 17:57     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Problem gelöst:

Ich habe von der SPM-Crew den Tip bekommen folgendes zu kompilieren:

cd /Users/Downloads/spm8/toolbox/vbm8/
mex -O ornlmMex.c ornlm.c

Das hat aber folgenden Fehler geworfen:

??? Error using ==> mex at 218
Unable to complete successfully.

Daraufhin bin ich auf folgenden hilfreichen Link gestoßen
(http://www.mathworks.com/matlabcentral/newsreader/view_thread/257847)
und habe dann den GCC installiert, jetzt funktioniert alles einwandfrei.

Danke für alle hilfreichen Tips!
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