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Regionale binäre Maske erstellen |
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| Chris122 |
Forum-Newbie
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Verfasst am: 15.02.2014, 20:18
Titel: Regionale binäre Maske erstellen
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Hallo Matlabprofis,
hat jemand eine Idee wie ich das Bsp. lösen kann?
1) Installation einer Toolbox (Nifti.zip) zum darstellen von Nifti Bilddaten
2) Ein kurzes Matlab-Skript mit Kommentaren zu schreiben über:
- die Analyze-files laden
- das AAL-file ist ein Atlas mit mehreren Hirnregionen. Hierbei jede Region einzeln als binäre Maske verwenden
- mit dieser Maske die Mittelwerte der beiden Konditionen getrennt auslesen (citalo und placebo).
Vielen Dank über eure Antworten,
Chris
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| Jan S |
Moderator
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Verfasst am: 15.02.2014, 23:52
Titel: Re: Regionale binäre Maske erstellen
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Hallo Chris122,
| Zitat: |
| hat jemand eine Idee wie ich das Bsp. lösen kann? |
Welches Beispiel?
| Zitat: |
| 1) Installation einer Toolbox (Nifti.zip) zum darstellen von Nifti Bilddaten |
Das kommt ganz auf die Toolbox an. Was ist "Nifti.zip"?
| Zitat: |
2) Ein kurzes Matlab-Skript mit Kommentaren zu schreiben über:
- die Analyze-files laden
- das AAL-file ist ein Atlas mit mehreren Hirnregionen. Hierbei jede Region einzeln als binäre Maske verwenden
- mit dieser Maske die Mittelwerte der beiden Konditionen getrennt auslesen (citalo und placebo). |
Nimmst Du an, dass sich die Leser in diesem Forum irgendetwas darunter vorstellen können? Was könnte ein "Analyse-File" sein? "AAL"? "Hirnregionen"? Was sind "beide" Konditionen?
Zur Zeit ist es nicht möglich etwas sinnvolles zu antworten. Bitte frage viel konkreter.
Gruß, Jan
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| Chris122 |
Themenstarter
Forum-Newbie
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Verfasst am: 16.02.2014, 07:57
Titel: Re: Regionale binäre Maske erstellen
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Hallo Jahn,
danke für deine AW.
| Zitat: |
| 1) Installation einer Toolbox (Nifti.zip) zum darstellen von Nifti Bilddaten |
Hier ist ein Link vom Download mit dem Inhalt:
http://en.pudn.com/downloads302/sou.....ath/detail1347716_en.html
Kann ich diesen unter Set Path einfügen oder muss ich diesen anders installieren?
| Zitat: |
2) Ein kurzes Matlab-Skript mit Kommentaren zu schreiben über:
- die Analyze-files laden
- das AAL-file ist ein Atlas mit mehreren Hirnregionen. Hierbei jede Region einzeln als binäre Maske verwenden
- mit dieser Maske die Mittelwerte der beiden Konditionen getrennt auslesen (citalo und placebo). |
Im Anhang befindet sich die Datei zu der Aufgabe. Es sind hdr und img Files.
Eine genauere Beschreibung hab ich von meinen Arbeitgeber auch nicht bekommen. Wenn ich fragen habe soll ich sie stellen.
Aber was wäre da eine sinnvolle Frage?
Danke,
Chris
| Beschreibung: |
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Download |
| Dateiname: |
ExampleData.rar |
| Dateigröße: |
910.97 KB |
| Heruntergeladen: |
578 mal |
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| Jan S |
Moderator
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Verfasst am: 16.02.2014, 20:21
Titel: Re: Regionale binäre Maske erstellen
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Hallo Chris122,
Wenn ich versuche dem von Dir angegebenen Link zu folgen, werde ich aufgefordert mich dort zu registrieren. Ich registriere mich grundsätzlich nicht auf chinesischen Download-Seiten, deren Lizenz-Bedingungenmir nicht klar werden.
Wenn in dieser Toolbox keine Installationshinweise zu finden sind, wäre es fahrlässig, wenn man diese erraten würde. Also suche in der Dokumentation oder wende Dich an den Autor.
Wenn Du einen Arbeitgeber hast, klingt das danach, als würdest Du für die Lösung der Aufgabe bezahlt. Dann ist es nicht sinnvoll, die Arbeitszeit der freiwillig beitragenden Forums-Benutzer in Anpsruch zu nehmen.
| Zitat: |
| Eine genauere Beschreibung hab ich von meinen Arbeitgeber auch nicht bekommen. Wenn ich fragen habe soll ich sie stellen. |
Wenn Dein Arbeitgeber Dir keine weiteren Hinweise gegeben hat, können wir sie auch nicht erraten. Möglicherweise ist es ein Teil dieser Aufgabe herauszufinden, ob Du in der Lage bist sinnvoll und offen nachzufragen, wenn Du zu wenige Informationen bekommst. Das ist nämlich für eine effiziente Arbeit unbedingt notwendig.
Auf jeden Fall bezweifele ich, dass dieses Forum die geeignete Stelle zur Klärung dieser Fragen ist.
Viele Grüße, Jan
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| Chris122 |
Themenstarter
Forum-Newbie
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Verfasst am: 16.02.2014, 20:39
Titel: Re: Regionale binäre Maske erstellen
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Hallo Jan,
danke für die AW. Ich werd auch dort in der Arbeit nachfragen.
Hier habe ich den original Link gefunden von wo diese Daten stammen:
http://www.mathworks.at/matlabcentr.....r-nifti-and-analyze-image
Im vorherigen Link wollte ich nur zeigen was der Inhalt von dem Folder gewesen ist. Eigentlich sollte die Aufgabe ganz einfach sein.
Aber ich versteh nicht ganz wie man .hdr oder img datein öffnen kann.
Ich hab auch schon Stunden damit verbracht danach zu suchen...
Lg,
Chris
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