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brauni |
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Verfasst am: 29.01.2016, 15:56
Titel: ROC-Kurve erstellen
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Uff, mir raucht der Kopf und ich komme einfach nicht weiter.
Mein Problem ist folgendes:
ich habe beispielsweise folgende zwei Vektoren:
A=[34 23 45 25 76 4 56 3 45 34] und
B=[14 3 25 5 56 0 36 0 25 14]
jeder Messwert eines Vektors (jede Spalte) ist ein Patient (hier also ingesamt 10Patienten), dabei ist die erste Spalte des Vektors A der gleiche Patient wie die erste Spalte des Vektors B.
Wenn ein Patient im Vektor A ein Messwert <27 (erster diagnostischer Test) zugeordnet bekommt ist er krank (hier also insgesamt 4 Patienten; Patient 2, 4, 6, 8 ).
Wie kann ich nun eine ROC-Kurve erstellen um den idealen Schwellenwert (bezüglich Sensitivität und Spezifität) für die Messwerte aus Vektor B zu bestimmen (zweiter diagnostischer Test)? wähle ich den Schwellenwert für den zweiten diagnostischen Test zu gering so habe ich viele falsch negative Patienten, wähle ich ihn zu hoch so habe ich viele falsch positive Patienten.
Folgende Funktion ist hierzu geeignet: perfcurve
Leider habe ich keine Ahnung wie ich die Funktion auf mein Problem anwenden kann. Ich komme einfach nicht weiter und habe leider auch keinen Ansatz. Vielleicht könnt ihr mir helfen. Jeder Tipp kann mir hier nützlich sein.
LG
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brauni |
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Verfasst am: 17.02.2016, 10:44
Titel:
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Hallo,
habe zwischenzeitlich das Problem selbst gelöst!!! Anbei meine Lösung für alle die vor einem ähnlichen Problem stehen:
http://de.mathworks.com/help/stats/perfcurve.html#brz5a2i-5
Geeignet für die Erstellung einer ROC Kurve ist die Funktion "perfcurve" (siehe Link oben):
1. Schritt: labels(A>=27)=1
-->gesunde Patienten bekommen eine 1 zugeordnet, kranke Patienten eine 0
2. Schritt: [X,Y,T,AUC,OPTROCPT]=perfcurve(labelsX,B,1)
3. Schritt: X und Y sind die Werte zur Erstellung der ROC-Kurve, d.h. figure; plot(X,Y)
und schon ist das Thema erledigt!!!
In diesem Beispiel ergibt sich eine perfekte ROC Kurve (AUC=1), d.h. der getestete diagnostische Test ist sehr gut! Sensitivität=1, Spezifität=1, Schwellenwert=14 (T)!!!
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